有关因事故等所致列车无法行驶时，或列车晚点时，仅限依照JR的运送条款之乘客营业规则中所规定的条件以及内容处理，无其他处理方式。旅客营业规则所规定之主要处理方式如下所示。
列车无法行驶时
购票之前
中止销售于列车无法行驶区间出发或到达，以及通过该区间的车票。但，若以巴士等其他的方法接驳，或经其他路径绕行时，则视同此区间为开通状态，有时可能销售车票。
已经持有车票时
如果停止旅行，则全额退还车资及费用。若是旅行中途停止，则退还尚未搭乘之区间的车资。在此状况下，全额退还停止行驶之列车的特急、急行费用等。
- 如果乘车中的特急列车到目的地前的中途车站即停止行驶时，可以搭乘后续的特急、急行列车（停止行驶的列车为急行列车时为急行列车）。在此状况下，则全额退还停止行驶的列车之特急、急行费用。但，若停驶的是品川~东京间（包括东海道新干线）以及东北、上越、北陆新干线的大宫~上野·东京间或仅上野~东京间停止行驶时，则仅退还特急、急行费用的差额。
卧铺费用仅限使用开始之后到早上6点为止的时段内，部分区间或全部区间无法使用时，则全额退还。 - 除此以外，可以免费回到出发车站。在此状况下，除了已经持乘车券中途下车的情况外，全额退还车资及费用。
- 有关定期券、回数券，仅限5天以上连续停运时，可延长有效期限或退款。
- 有关特惠车票，根据各种商品，其退款等的处理不尽相同，请咨询承办人员。
列车晚点时
- 特急、急行列车若比原定到达时刻晚点2小时以上时，全额退还特急、急行费用。
- 由于列车等的晚点，致无法衔接上换乘之列车等，且较原定到达时刻晚点2小时以上时，中途中止旅行或回到出发车站时的处理，比照列车无法行驶的状况。
- 有关特急、急行列车可以使用的特惠车票，根据商品之不同，退款的处理亦不尽相同，故请咨询承办人员。